联盟361年，小智终于完成了世界各地的旅行。
带着自己最强的六只精灵：皮卡丘、喷火龙、甲贺忍蛙、卡比兽、快龙、路卡利欧，参加世界瞩目的全国大赛。
突然出现的“问答游戏”，让整个精灵世界开始崩坏！
为了再一次拯救这个崩坏的世界，小智所经历的一切被未知存在公诸于世。
小智：我摊牌了，没错，你们的命都是我救的！
渡：这个戴着帽子的少年不会是我失散多年的亲儿子吧？
大吾：我观小智有大帝之姿，他居然认识所有神兽！
莎莉娜：什么，在我之前居然还有其他女孩和小智一起拯救过世界？
希罗娜：我就说吧，阿尔宙斯选中的少年注定成就不凡！
大木博士：什么阿尔宙斯，小智明明是凤王选中的训练家！